Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P61574 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms