Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms