Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms