Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA9P57773 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA9P57773 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA9P57773 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA9P57773 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA9P57773 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA9P57773 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA9P57773 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA9P57773 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA9P57773 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA9P57773 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA9P57773 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA9P57773 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA9P57773 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA9P57773 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA9P57773 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA9P57773 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA9P57773 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA9P57773 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA9P57773 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA9P57773 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms