Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX10P56693 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX10P56693 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX10P56693 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX10P56693 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX10P56693 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX10P56693 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX10P56693 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX10P56693 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX10P56693 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX10P56693 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX10P56693 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX10P56693 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX10P56693 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX10P56693 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX10P56693 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX10P56693 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX10P56693 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX10P56693 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms