Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA1P56199 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA1P56199 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA1P56199 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA1P56199 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA1P56199 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms