Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSE1LP55060 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSE1LP55060 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSE1LP55060 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms