Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN5P54829 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN5P54829 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms