Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms