Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHB3P54753 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms