Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 54.84□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 31.6
SUB1P53999 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 23.9□□□□□ -1.783e-9■■■■■ 31.6
SUB1P53999 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.412e-9■■■■■ 31.6
SUB1P53999 IQGAP1-215ENST00000561086 2871 ntTSL 22.63□□□□□ -1.992e-9■■■■■ 31.6
SUB1P53999 IQGAP1-204ENST00000558957 2313 ntTSL 22.5□□□□□ -2.012e-9■■■■■ 31.6
SUB1P53999 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 24.59□□□□□ -1.671e-61■■■■■ 31.6
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SUB1P53999 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.871e-9■■■■■ 31.5
SUB1P53999 OGFOD1-201ENST00000336111 2415 ntTSL 27.51□□□□□ -1.211e-9■■■■■ 31.5
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SUB1P53999 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 31.4
SUB1P53999 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-11■■■■■ 31.4
SUB1P53999 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 31.4
SUB1P53999 CAPZA1-204ENST00000476936 867 ntTSL 33.49□□□□□ -1.852e-17■■■■■ 31.4
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SUB1P53999 EIF2B5-209ENST00000481054 3460 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.565e-8■■■■■ 31.2
SUB1P53999 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-12■■■■■ 31.2
SUB1P53999 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.584e-12■■■■■ 31.2
SUB1P53999 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.234e-12■■■■■ 31.2
SUB1P53999 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.084e-12■■■■■ 31.2
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SUB1P53999 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.456e-12■■■■■ 31.1
SUB1P53999 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.786e-12■■■■■ 31.1
SUB1P53999 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-13■■■■■ 31.1
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SUB1P53999 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.832e-12■■■■■ 31.1
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SUB1P53999 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 30.8
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SUB1P53999 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 CSNK1E-207ENST00000430335 996 ntTSL 515.43■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 RAC3-202ENST00000580965 831 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 30.8
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SUB1P53999 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 HAUS4-215ENST00000554651 815 ntTSL 314.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PLXND1-204ENST00000504524 1701 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PLA2G6-214ENST00000448094 1147 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 RPL3-203ENST00000402527 1205 ntTSL 514.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 HAUS4-214ENST00000554516 983 ntTSL 213.8□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PTGDS-206ENST00000457950 661 ntTSL 313.42□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PLXND1-214ENST00000512744 2662 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PTGDS-201ENST00000371623 921 ntTSL 213.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 KIF22-205ENST00000563666 1603 ntTSL 512.74□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 HAUS4-216ENST00000555040 1107 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 THOC3-206ENST00000513006 602 ntTSL 312.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 RPL3-208ENST00000460589 630 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PLA2G6-216ENST00000452794 781 ntTSL 412.11□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 30.8
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