Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA3P52797 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA3P52797 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNA3P52797 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA3P52797 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA3P52797 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms