Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV2P52735 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAV2P52735 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAV2P52735 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAV2P52735 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAV2P52735 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAV2P52735 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAV2P52735 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAV2P52735 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAV2P52735 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VAV2P52735 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAV2P52735 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAV2P52735 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAV2P52735 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAV2P52735 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms