Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCNN1GP51170 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms