Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK2P49760 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK2P49760 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK2P49760 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK2P49760 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK2P49760 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK2P49760 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK2P49760 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK2P49760 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK2P49760 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLK2P49760 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK2P49760 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK2P49760 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK2P49760 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK2P49760 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK2P49760 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK2P49760 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK2P49760 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK2P49760 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK2P49760 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK2P49760 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CLK2P49760 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK2P49760 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK2P49760 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK2P49760 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK2P49760 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK2P49760 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK2P49760 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK2P49760 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK2P49760 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms