Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPINT3P49223 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINT3P49223 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPINT3P49223 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms