Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC1P48995 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC1P48995 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms