Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC10P48553 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC10P48553 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC10P48553 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms