Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXRGP48443 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RXRGP48443 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RXRGP48443 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXRGP48443 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms