Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA8P48165 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA8P48165 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA8P48165 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA8P48165 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA8P48165 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA8P48165 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA8P48165 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA8P48165 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA8P48165 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA8P48165 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA8P48165 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA8P48165 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA8P48165 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA8P48165 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA8P48165 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA8P48165 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA8P48165 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA8P48165 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA8P48165 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA8P48165 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA8P48165 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA8P48165 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA8P48165 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA8P48165 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA8P48165 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA8P48165 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA8P48165 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA8P48165 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA8P48165 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA8P48165 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA8P48165 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA8P48165 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA8P48165 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA8P48165 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA8P48165 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA8P48165 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms