Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UTRNP46939 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTRNP46939 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTRNP46939 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTRNP46939 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UTRNP46939 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UTRNP46939 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UTRNP46939 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTRNP46939 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UTRNP46939 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTRNP46939 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms