Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSFP46459 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSFP46459 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSFP46459 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSFP46459 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSFP46459 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NSFP46459 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSFP46459 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms