Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSOP43234 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSOP43234 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSOP43234 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSOP43234 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSOP43234 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSOP43234 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSOP43234 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSOP43234 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSOP43234 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSOP43234 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSOP43234 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSOP43234 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSOP43234 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSOP43234 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSOP43234 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSOP43234 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms