Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A4P43007 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms