Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR1BP42025 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms