Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHAP40939 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHAP40939 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HADHAP40939 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HADHAP40939 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HADHAP40939 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HADHAP40939 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms