Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 MRP13YGR084C 1020 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YGR273CYGR273C 525 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YLF2YHL014C 1218 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 ELF1YKL160W 438 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YRB30YGL164C 1323 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RNY1YPL123C 1305 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SLM5YCR024C 1479 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 BUD5YCR038C 1929 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 ELM1YKL048C 1923 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 DPH6YLR143W 2058 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 ADY3YDL239C 2373 nt3.66□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YMR111CYMR111C 1389 nt3.65□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RNA14YMR061W 2034 nt3.65□□□□□ -1.82
DDI1P40087 MNT4YNR059W 1743 nt3.65□□□□□ -1.82
DDI1P40087 ALO1YML086C 1581 nt3.65□□□□□ -1.82
DDI1P40087 DOS2YDR068W 933 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 SNL1YIL016W 480 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 CAP2YIL034C 864 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 AIM22YJL046W 1230 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 ASC1YMR116C 960 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 PEP4YPL154C 1218 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 STB3YDR169C 1542 nt3.65□□□□□ -1.83
DDI1P40087 MSK1YNL073W 1731 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 HOM2YDR158W 1098 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YGL188CYGL188C 174 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YLR428CYLR428C 345 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YOR342CYOR342C 960 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 ATG21YPL100W 1491 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 GCN5YGR252W 1320 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 SAF1YBR280C 1914 nt3.64□□□□□ -1.83
DDI1P40087 MCD4YKL165C 2760 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 MUP3YHL036W 1641 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 DIN7YDR263C 1293 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YGL199CYGL199C 471 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 RPB3YIL021W 957 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 MRT4YKL009W 711 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YKR075CYKR075C 924 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 RPL15BYMR121C 615 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YOR022CYOR022C 2148 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YOR379CYOR379C 339 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YPL278CYPL278C 303 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 DSS4YPR017C 432 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 FRM2YCL026C-A 582 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 NFI1YOR156C 2181 nt3.63□□□□□ -1.83
DDI1P40087 SEG1YMR086W 2883 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 RSC58YLR033W 1509 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YDR230WYDR230W 348 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 SEC53YFL045C 765 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YNK1YKL067W 462 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 TIS11YLR136C 858 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YBL036CYBL036C 774 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 FOL3YMR113W 1284 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 SCD6YPR129W 1050 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 RER1YCL001W 567 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 LOS1YKL205W 3303 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 FBP26YJL155C 1359 nt3.62□□□□□ -1.83
DDI1P40087 RNT1YMR239C 1416 nt3.61□□□□□ -1.83
DDI1P40087 FAT1YBR041W 2010 nt3.61□□□□□ -1.83
DDI1P40087 VAC17YCL063W 1272 nt3.61□□□□□ -1.83
DDI1P40087 NUS1YDL193W 1128 nt3.61□□□□□ -1.83
DDI1P40087 API2YDR525W 330 nt3.61□□□□□ -1.83
DDI1P40087 WRS1YOL097C 1299 nt3.61□□□□□ -1.83
DDI1P40087 STU1YBL034C 4542 nt3.61□□□□□ -1.83
DDI1P40087 TAF8YML114C 1533 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 ECM16YMR128W 3804 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 ROK1YGL171W 1695 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 NOP6YDL213C 678 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 GEP4YHR100C 558 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 CCS1YMR038C 750 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YER137C-AYER137C-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YER159C-AYER159C-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YJR026WYJR026W 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YJR028WYJR028W 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YAR010CYAR010C 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YML040WYML040W 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YML045W-AYML045W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YMR051CYMR051C 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 IME4YGL192W 1803 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 HER2YMR293C 1395 nt3.6□□□□□ -1.83
DDI1P40087 SPO1YNL012W 1896 nt3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms