Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLCN1P35523 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN1P35523 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms