Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP2P32456 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP2P32456 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP2P32456 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP2P32456 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP2P32456 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP2P32456 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP2P32456 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP2P32456 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP2P32456 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP2P32456 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP2P32456 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP2P32456 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms