Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA3P32297 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms