Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ1P31415 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ1P31415 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms