Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA9P31269 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms