Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms