Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA3P29320 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA3P29320 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA3P29320 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA3P29320 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA3P29320 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA3P29320 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA3P29320 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA3P29320 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA3P29320 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA3P29320 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA3P29320 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPHA3P29320 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms