Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms