Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA5P28066 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA5P28066 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms