Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA2P26232 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms