Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNCP24863 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNCP24863 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNCP24863 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNCP24863 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNCP24863 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNCP24863 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNCP24863 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNCP24863 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNCP24863 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNCP24863 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNCP24863 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNCP24863 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNCP24863 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNCP24863 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms