Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCHP24723 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCHP24723 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms