Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX3P23760 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX3P23760 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX3P23760 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX3P23760 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAX3P23760 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX3P23760 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX3P23760 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX3P23760 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAX3P23760 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX3P23760 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX3P23760 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX3P23760 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms