Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGA6P23229 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA6P23229 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms