Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGS1P23219 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGS1P23219 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms