Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB4P21439 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB4P21439 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms