Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms