Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMY2BP19961 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMY2BP19961 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms