Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFE3P19532 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFE3P19532 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFE3P19532 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFE3P19532 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFE3P19532 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms