Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCAM1P19320 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCAM1P19320 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms