Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI1P19237 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms