Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT15P19012 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT15P19012 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT15P19012 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT15P19012 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT15P19012 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT15P19012 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT15P19012 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT15P19012 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT15P19012 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT15P19012 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT15P19012 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms