Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN1P18031 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms